Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MCRIP1C9JLW8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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