Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L13C9JLJ4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L13C9JLJ4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L13C9JLJ4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L13C9JLJ4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L13C9JLJ4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L13C9JLJ4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L13C9JLJ4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L13C9JLJ4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L13C9JLJ4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L13C9JLJ4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L13C9JLJ4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L13C9JLJ4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L13C9JLJ4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L13C9JLJ4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L13C9JLJ4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L13C9JLJ4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L13C9JLJ4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L13C9JLJ4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP17L13C9JLJ4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP17L13C9JLJ4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms