Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf172C9J069 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf172C9J069 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms