Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
B4DXG7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DXG7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DXG7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DXG7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DXG7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DXG7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DXG7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DXG7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DXG7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DXG7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DXG7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DXG7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DXG7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DXG7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DXG7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DXG7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DXG7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DXG7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DXG7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DXG7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DXG7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
B4DXG7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
B4DXG7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
B4DXG7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms