Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC169A6NNP5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC169A6NNP5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms