Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH2D7A6NKC9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms