Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC69A6NI79 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms