Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CFAP73A6NFT4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CFAP73A6NFT4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms