Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA6L4A6NEF3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GOLGA6L4A6NEF3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms