Protein–RNA interactions for Protein: A6NDU8

C5orf51, UPF0600 protein C5orf51, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf51A6NDU8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf51A6NDU8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms