Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MAP1LC3B2A6NCE7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms