Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
XIRP2A4UGR9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XIRP2A4UGR9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
XIRP2A4UGR9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
XIRP2A4UGR9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
XIRP2A4UGR9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
XIRP2A4UGR9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
XIRP2A4UGR9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
XIRP2A4UGR9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XIRP2A4UGR9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
XIRP2A4UGR9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
XIRP2A4UGR9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XIRP2A4UGR9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
XIRP2A4UGR9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
XIRP2A4UGR9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
XIRP2A4UGR9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
XIRP2A4UGR9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
XIRP2A4UGR9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms