Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 BIVM-201ENST00000257336 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PRDM10-207ENST00000528746 6182 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC079061.1-201ENST00000499579 3075 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TACC2-212ENST00000453444 9158 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM160A1-201ENST00000435205 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 EPB41-203ENST00000349460 3029 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CKAP2L-201ENST00000302450 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA1841-203ENST00000402291 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SCAF11-202ENST00000369367 7543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF702P-201ENST00000270443 2990 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RTL10-203ENST00000407472 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 EFCAB12-204ENST00000505956 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CORO2B-203ENST00000543950 3611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 POGK-202ENST00000367876 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CSNK2A1-202ENST00000349736 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PAMR1-208ENST00000621476 2842 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CUL2-204ENST00000374751 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MTF2-201ENST00000370298 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CHFR-201ENST00000266880 11133 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKRD26P1-201ENST00000566201 3921 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 GOLGA6D-202ENST00000618219 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 IGSF3-201ENST00000318837 3842 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ST3GAL3-211ENST00000361812 513 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP78-201ENST00000364622 118 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA35-201ENST00000386104 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MT1P3-201ENST00000421424 177 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL856P-201ENST00000461754 298 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AL451124.1-201ENST00000478520 1026 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL78P-201ENST00000495193 281 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00967-202ENST00000517725 259 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 CCAR2-208ENST00000521301 337 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC012653.1-201ENST00000558410 931 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC093484.3-201ENST00000578296 449 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR3918-201ENST00000581555 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC093484.4-201ENST00000583934 461 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC233724.14-201ENST00000603531 331 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AC245028.3-201ENST00000618197 285 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AL356599.1-202ENST00000626919 218 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TARS-216ENST00000627006 171 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 VWC2-201ENST00000340652 11299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KLHL30-201ENST00000409223 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 AL031595.3-201ENST00000624919 14262 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 EGR3-201ENST00000317216 4336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KPNB1-201ENST00000290158 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP5G3-201ENST00000284727 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 KANK4-203ENST00000371150 3023 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFYVE27-207ENST00000423811 3045 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-9Q9BYP9 TTLL3-202ENST00000383827 4834 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms