Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X1

SERP1, Stress-associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1Q9Y6X1 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SERP1Q9Y6X1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms