Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLXND1Q9Y4D7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLXND1Q9Y4D7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms