Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF330Q9Y3S2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF330Q9Y3S2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms