Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y9

KLF13, Krueppel-like factor 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF13Q9Y2Y9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLF13Q9Y2Y9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLF13Q9Y2Y9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms