Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HPSEQ9Y251 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HPSEQ9Y251 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms