Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HDAC5Q9UQL6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HDAC5Q9UQL6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms