Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IGSF9BQ9UPX0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGSF9BQ9UPX0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms