Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM35Q9UPQ4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM35Q9UPQ4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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