Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP18Q9UMW8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
USP18Q9UMW8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms