Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BARX2Q9UMQ3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BARX2Q9UMQ3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BARX2Q9UMQ3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BARX2Q9UMQ3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms