Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PACSIN3Q9UKS6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PACSIN3Q9UKS6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms