Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FBXO3Q9UK99 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO3Q9UK99 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms