Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RPUSD1Q9UJJ7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms