Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CFDP1Q9UEE9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFDP1Q9UEE9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms