Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
DKK2Q9UBU2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
DKK2Q9UBU2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms