Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MBD2Q9UBB5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms