Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
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COL20A1Q9P218 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL20A1Q9P218 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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COL20A1Q9P218 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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COL20A1Q9P218 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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COL20A1Q9P218 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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COL20A1Q9P218 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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COL20A1Q9P218 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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COL20A1Q9P218 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COL20A1Q9P218 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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