Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KCMF1Q9P0J7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms