Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RTEL1Q9NZ71 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RTEL1Q9NZ71 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms