Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C9orf78Q9NZ63 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms