Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RDH8Q9NYR8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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RDH8Q9NYR8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RDH8Q9NYR8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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