Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DNAJC28Q9NX36 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DNAJC28Q9NX36 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms