Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms