Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RPRMQ9NS64 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms