Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TOPORSQ9NS56 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms