Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NDUFA4L2Q9NRX3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms