Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
C11orf49Q9H6J7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms