Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF41Q9H4P4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF41Q9H4P4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF41Q9H4P4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF41Q9H4P4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF41Q9H4P4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF41Q9H4P4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF41Q9H4P4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF41Q9H4P4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF41Q9H4P4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF41Q9H4P4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF41Q9H4P4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF41Q9H4P4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms