Protein–RNA interactions for Protein: Q9H165

BCL11A, B-cell lymphoma/leukemia 11A, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11AQ9H165 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BCL11AQ9H165 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11AQ9H165 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms