Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CTDSP1Q9GZU7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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CTDSP1Q9GZU7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CTDSP1Q9GZU7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CTDSP1Q9GZU7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CTDSP1Q9GZU7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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