Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ7

KRTAP4-1, Keratin-associated protein 4-1, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-1Q9BYQ7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
KRTAP4-1Q9BYQ7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms