Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIFKQ9BYG3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms