Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP3Q9BWW4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms