Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GINS3Q9BRX5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms