Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MESP1Q9BRJ9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms