Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLF1Q9BQI6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLF1Q9BQI6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms