Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBA1CQ9BQE3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms